一、来源不同
1、原生app：所谓的原生APP其实就是和移动设备所装置的操作系统运用的同一种变成语言研发的APP！
2、web app：web app是由html5所做的网站通过一些打包平台或者使用工具打包而成的软件。
二、开发成本不同
1、原生app：原生app开发成本高，需要使用单独的开发工具进行开发。
2、web app：web app开发成本低，不需要使用单独的开发工具进行开发。
费用方面。原生应用的开发成本是大于web应用的成本。安卓官方给定的安卓开发语言是java，而web应用的开发没有语言限制，你可以是java，python，php，asp，aspx等等主流的文语言都可以。而相对于原生应用web应用所需要的费用会大大降低，而许多webapp基本上就是一个网站打包成应用的模式。所以费用相对来说低。
性能方面。原生应用所有的资源已基本上写在了应用里面，所以打开速度相对于从服务器端还要再次加载资源的web应用来说会快很多。原生应用完美的支持了手机的底层功能。而web应用打开速度还要根据当前网络环境、服务器环境等因素所影响，这性能方面输给了原生应用。
稳定性
目前市场的web版的APP多为模板，这种模板价格便宜，但是功能无法拓展，而且随着市场上浏览器、技术的进步，会逐步出现各种问题，稳定性根本无法保证。